Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA2Q69YH5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA2Q69YH5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA2Q69YH5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA2Q69YH5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA2Q69YH5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms