Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WSCD1Q658N2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WSCD1Q658N2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
WSCD1Q658N2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WSCD1Q658N2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms