Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRAGBQ5VZM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RRAGBQ5VZM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RRAGBQ5VZM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRAGBQ5VZM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms