Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFMBT2Q5VUG0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFMBT2Q5VUG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms