Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LDLRAP1Q5SW96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAP1Q5SW96 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms