Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNFT1Q5M7Z0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT1Q5M7Z0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT1Q5M7Z0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT1Q5M7Z0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms