Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP13A4Q4VNC1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP13A4Q4VNC1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP13A4Q4VNC1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP13A4Q4VNC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms