Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM229BQ4G0N7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM229BQ4G0N7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM229BQ4G0N7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM229BQ4G0N7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms