Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC27Q2M243 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC27Q2M243 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC27Q2M243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms