Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSG1Q2KHT4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSG1Q2KHT4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSG1Q2KHT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms