Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GEN1Q17RS7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GEN1Q17RS7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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