Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMPG1Q17R60 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPG1Q17R60 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMPG1Q17R60 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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