Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRA6Q16445 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA6Q16445 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA6Q16445 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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