Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX2Q16385 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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