Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NECTIN1Q15223 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NECTIN1Q15223 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NECTIN1Q15223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
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