Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUNX3Q13761 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNX3Q13761 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNX3Q13761 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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