Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB3BPQ13352 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGB3BPQ13352 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB3BPQ13352 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGB3BPQ13352 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms