Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51Q06609 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51Q06609 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51Q06609 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD51Q06609 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51Q06609 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51Q06609 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms