Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX2Q02962 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX2Q02962 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms