Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF8Q02556 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF8Q02556 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRF8Q02556 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF8Q02556 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms