Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK2A1P68400 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A1P68400 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms