Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVK-24P63145 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ERVK-24P63145 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERVK-24P63145 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVK-24P63145 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms