Protein–RNA interactions for Protein: P61647

ST8SIA6, Alpha-2,8-sialyltransferase 8F, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA6P61647 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ST8SIA6P61647 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ST8SIA6P61647 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ST8SIA6P61647 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ST8SIA6P61647 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms