Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVS71-1P61550 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVS71-1P61550 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVS71-1P61550 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms