Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVFRD-1P60508 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVFRD-1P60508 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVFRD-1P60508 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms