Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2E1P51965 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2E1P51965 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2E1P51965 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2E1P51965 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2E1P51965 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms