Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSKP41240 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSKP41240 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSKP41240 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSKP41240 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSKP41240 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSKP41240 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSKP41240 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSKP41240 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSKP41240 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSKP41240 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSKP41240 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSKP41240 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSKP41240 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSKP41240 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSKP41240 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSKP41240 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSKP41240 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSKP41240 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSKP41240 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSKP41240 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSKP41240 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSKP41240 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSKP41240 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSKP41240 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSKP41240 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSKP41240 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSKP41240 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSKP41240 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSKP41240 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSKP41240 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSKP41240 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSKP41240 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSKP41240 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSKP41240 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSKP41240 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSKP41240 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSKP41240 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSKP41240 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CSKP41240 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSKP41240 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSKP41240 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSKP41240 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSKP41240 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSKP41240 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSKP41240 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSKP41240 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSKP41240 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSKP41240 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSKP41240 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSKP41240 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSKP41240 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSKP41240 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSKP41240 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSKP41240 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSKP41240 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSKP41240 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSKP41240 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSKP41240 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSKP41240 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSKP41240 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSKP41240 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSKP41240 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSKP41240 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSKP41240 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSKP41240 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSKP41240 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSKP41240 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSKP41240 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSKP41240 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSKP41240 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSKP41240 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSKP41240 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSKP41240 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSKP41240 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSKP41240 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSKP41240 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSKP41240 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms