Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHI3L1P36222 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHI3L1P36222 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHI3L1P36222 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L1P36222 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L1P36222 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms