Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNF1BP35680 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNF1BP35680 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNF1BP35680 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms