Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR7P32248 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR7P32248 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR7P32248 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR7P32248 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR7P32248 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR7P32248 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR7P32248 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR7P32248 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR7P32248 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR7P32248 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR7P32248 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR7P32248 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR7P32248 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR7P32248 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR7P32248 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR7P32248 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR7P32248 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR7P32248 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR7P32248 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR7P32248 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR7P32248 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR7P32248 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR7P32248 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR7P32248 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR7P32248 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR7P32248 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR7P32248 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR7P32248 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR7P32248 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR7P32248 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR7P32248 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR7P32248 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR7P32248 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR7P32248 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR7P32248 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR7P32248 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR7P32248 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR7P32248 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR7P32248 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR7P32248 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR7P32248 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR7P32248 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR7P32248 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR7P32248 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR7P32248 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR7P32248 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR7P32248 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR7P32248 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR7P32248 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR7P32248 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR7P32248 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR7P32248 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR7P32248 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR7P32248 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR7P32248 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR7P32248 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR7P32248 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR7P32248 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR7P32248 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR7P32248 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR7P32248 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms