Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC13P31276 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC13P31276 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC13P31276 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms