Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP1P29466 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP1P29466 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP1P29466 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP1P29466 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP1P29466 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP1P29466 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP1P29466 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP1P29466 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP1P29466 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP1P29466 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP1P29466 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP1P29466 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP1P29466 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASP1P29466 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP1P29466 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP1P29466 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP1P29466 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP1P29466 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP1P29466 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP1P29466 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP1P29466 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP1P29466 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP1P29466 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP1P29466 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP1P29466 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP1P29466 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP1P29466 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP1P29466 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP1P29466 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP1P29466 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP1P29466 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP1P29466 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP1P29466 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP1P29466 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP1P29466 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP1P29466 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP1P29466 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP1P29466 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP1P29466 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP1P29466 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP1P29466 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP1P29466 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP1P29466 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP1P29466 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP1P29466 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP1P29466 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP1P29466 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP1P29466 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP1P29466 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP1P29466 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CASP1P29466 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CASP1P29466 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP1P29466 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP1P29466 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP1P29466 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP1P29466 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP1P29466 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP1P29466 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP1P29466 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP1P29466 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP1P29466 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP1P29466 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP1P29466 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP1P29466 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP1P29466 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP1P29466 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP1P29466 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP1P29466 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP1P29466 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP1P29466 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP1P29466 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP1P29466 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP1P29466 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP1P29466 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP1P29466 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms