Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN1P18031 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPN1P18031 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN1P18031 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN1P18031 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms