Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPI1P17947 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPI1P17947 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPI1P17947 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPI1P17947 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPI1P17947 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPI1P17947 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPI1P17947 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPI1P17947 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPI1P17947 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPI1P17947 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPI1P17947 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPI1P17947 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPI1P17947 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPI1P17947 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPI1P17947 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPI1P17947 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPI1P17947 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPI1P17947 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPI1P17947 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPI1P17947 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPI1P17947 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPI1P17947 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPI1P17947 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPI1P17947 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPI1P17947 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPI1P17947 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPI1P17947 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPI1P17947 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPI1P17947 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPI1P17947 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPI1P17947 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPI1P17947 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPI1P17947 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPI1P17947 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPI1P17947 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPI1P17947 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPI1P17947 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPI1P17947 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPI1P17947 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPI1P17947 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPI1P17947 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPI1P17947 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPI1P17947 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPI1P17947 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPI1P17947 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPI1P17947 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPI1P17947 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPI1P17947 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPI1P17947 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPI1P17947 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPI1P17947 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPI1P17947 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPI1P17947 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPI1P17947 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPI1P17947 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPI1P17947 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPI1P17947 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPI1P17947 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPI1P17947 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPI1P17947 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPI1P17947 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPI1P17947 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPI1P17947 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPI1P17947 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPI1P17947 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPI1P17947 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPI1P17947 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPI1P17947 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPI1P17947 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPI1P17947 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPI1P17947 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPI1P17947 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPI1P17947 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPI1P17947 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPI1P17947 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPI1P17947 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPI1P17947 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPI1P17947 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms