Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCG2P13521 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCG2P13521 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCG2P13521 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCG2P13521 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCG2P13521 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCG2P13521 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCG2P13521 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG2P13521 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SCG2P13521 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG2P13521 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG2P13521 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG2P13521 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG2P13521 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCG2P13521 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCG2P13521 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCG2P13521 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCG2P13521 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCG2P13521 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCG2P13521 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCG2P13521 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCG2P13521 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCG2P13521 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCG2P13521 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCG2P13521 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCG2P13521 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCG2P13521 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCG2P13521 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCG2P13521 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCG2P13521 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCG2P13521 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCG2P13521 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCG2P13521 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG2P13521 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG2P13521 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG2P13521 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG2P13521 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG2P13521 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG2P13521 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCG2P13521 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCG2P13521 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCG2P13521 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCG2P13521 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCG2P13521 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG2P13521 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG2P13521 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG2P13521 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG2P13521 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG2P13521 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG2P13521 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCG2P13521 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCG2P13521 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCG2P13521 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCG2P13521 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCG2P13521 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCG2P13521 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCG2P13521 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCG2P13521 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCG2P13521 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCG2P13521 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCG2P13521 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SCG2P13521 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG2P13521 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG2P13521 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG2P13521 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG2P13521 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG2P13521 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCG2P13521 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCG2P13521 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCG2P13521 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCG2P13521 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCG2P13521 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG2P13521 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG2P13521 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG2P13521 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG2P13521 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG2P13521 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCG2P13521 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCG2P13521 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCG2P13521 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.2 ms