Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL3P10147 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL3P10147 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL3P10147 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL3P10147 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL3P10147 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL3P10147 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL3P10147 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL3P10147 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL3P10147 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL3P10147 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL3P10147 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL3P10147 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL3P10147 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL3P10147 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL3P10147 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL3P10147 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL3P10147 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL3P10147 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL3P10147 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL3P10147 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL3P10147 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL3P10147 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL3P10147 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL3P10147 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL3P10147 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL3P10147 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL3P10147 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL3P10147 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL3P10147 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL3P10147 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL3P10147 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL3P10147 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL3P10147 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL3P10147 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL3P10147 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL3P10147 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL3P10147 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL3P10147 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL3P10147 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL3P10147 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL3P10147 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL3P10147 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL3P10147 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL3P10147 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL3P10147 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL3P10147 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL3P10147 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL3P10147 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL3P10147 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL3P10147 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL3P10147 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL3P10147 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL3P10147 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL3P10147 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL3P10147 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL3P10147 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL3P10147 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL3P10147 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL3P10147 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL3P10147 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL3P10147 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL3P10147 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL3P10147 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL3P10147 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL3P10147 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL3P10147 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL3P10147 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL3P10147 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL3P10147 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL3P10147 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL3P10147 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL3P10147 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCL3P10147 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL3P10147 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL3P10147 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL3P10147 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL3P10147 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms