Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI4P10075 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI4P10075 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI4P10075 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI4P10075 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI4P10075 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI4P10075 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI4P10075 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI4P10075 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI4P10075 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI4P10075 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI4P10075 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI4P10075 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI4P10075 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI4P10075 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI4P10075 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI4P10075 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI4P10075 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI4P10075 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI4P10075 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI4P10075 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI4P10075 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI4P10075 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI4P10075 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI4P10075 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI4P10075 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI4P10075 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI4P10075 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI4P10075 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI4P10075 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLI4P10075 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI4P10075 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI4P10075 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GLI4P10075 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI4P10075 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI4P10075 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI4P10075 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI4P10075 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI4P10075 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI4P10075 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI4P10075 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI4P10075 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI4P10075 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI4P10075 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI4P10075 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI4P10075 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI4P10075 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI4P10075 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI4P10075 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI4P10075 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI4P10075 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI4P10075 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI4P10075 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI4P10075 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI4P10075 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI4P10075 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI4P10075 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI4P10075 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI4P10075 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI4P10075 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI4P10075 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI4P10075 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms