Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
EIF3JO75822 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EIF3JO75822 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3JO75822 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF3JO75822 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms