Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2O75044 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRGAP2O75044 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRGAP2O75044 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms