Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5O60239 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5O60239 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5O60239 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5O60239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5O60239 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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