Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD21O60216 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD21O60216 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD21O60216 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD21O60216 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD21O60216 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD21O60216 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD21O60216 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD21O60216 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD21O60216 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD21O60216 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD21O60216 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD21O60216 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD21O60216 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD21O60216 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD21O60216 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD21O60216 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD21O60216 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD21O60216 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD21O60216 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD21O60216 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD21O60216 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD21O60216 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD21O60216 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD21O60216 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD21O60216 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD21O60216 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD21O60216 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD21O60216 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD21O60216 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD21O60216 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD21O60216 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD21O60216 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD21O60216 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD21O60216 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD21O60216 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD21O60216 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD21O60216 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD21O60216 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD21O60216 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD21O60216 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD21O60216 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD21O60216 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD21O60216 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD21O60216 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD21O60216 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD21O60216 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD21O60216 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD21O60216 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD21O60216 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD21O60216 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD21O60216 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD21O60216 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD21O60216 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD21O60216 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD21O60216 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAD21O60216 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD21O60216 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD21O60216 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD21O60216 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD21O60216 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD21O60216 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD21O60216 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD21O60216 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD21O60216 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD21O60216 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD21O60216 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD21O60216 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD21O60216 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD21O60216 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD21O60216 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD21O60216 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD21O60216 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD21O60216 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD21O60216 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD21O60216 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD21O60216 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD21O60216 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD21O60216 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD21O60216 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD21O60216 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD21O60216 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms