Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP9BO43861 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP9BO43861 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP9BO43861 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms