Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAFD1O14545 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAFD1O14545 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAFD1O14545 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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