Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PQ18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PQ18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PQ18 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PQ18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PQ18 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PQ18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PQ18 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PQ18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PQ18 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PQ18 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PQ18 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PQ18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PQ18 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PQ18 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PQ18 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PQ18 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PQ18 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PQ18 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PQ18 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PQ18 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E9PQ18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E9PQ18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E9PQ18 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E9PQ18 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E9PQ18 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PQ18 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PQ18 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PQ18 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E9PQ18 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PQ18 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PQ18 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E9PQ18 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PQ18 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E9PQ18 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PQ18 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PQ18 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E9PQ18 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PQ18 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E9PQ18 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PQ18 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PQ18 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PQ18 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PQ18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E9PQ18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PQ18 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PQ18 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E9PQ18 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PQ18 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PQ18 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PQ18 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PQ18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E9PQ18 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PQ18 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PQ18 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PQ18 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PQ18 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PQ18 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PQ18 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PQ18 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PQ18 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PQ18 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PQ18 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PQ18 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PQ18 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PQ18 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PQ18 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PQ18 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PQ18 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PQ18 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms