Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L5A8MUK1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L5A8MUK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L5A8MUK1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms