Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L5A8MUK1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L5A8MUK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L5A8MUK1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L5A8MUK1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L5A8MUK1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L5A8MUK1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L5A8MUK1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms