Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT87PA6NCN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT87PA6NCN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT87PA6NCN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms