Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NRXN3Q9Y4C0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NRXN3Q9Y4C0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN3Q9Y4C0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms