Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASF1AQ9Y294 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASF1AQ9Y294 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASF1AQ9Y294 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms