Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGSF9BQ9UPX0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9BQ9UPX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF9BQ9UPX0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms