Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FZD4Q9ULV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FZD4Q9ULV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms